在進行屋頂綠化施工時，首先在原屋面增加一層柔性防水層，且按相關技術規范操作，屋面進行兩次閉水試驗以確保防水質量，第一次在屋頂綠化施工前進行，第二次在綠化種植前，每次閉水時間不小于72小時。

防水層上必須設置防根刺破的保護層。保護層應選用輕質耐腐材料，接縫應做處理，防止根從接縫處伸入屋面結構層，保護層應設置防止移位的加固措施。

保護層上必須設置蓄排水層。蓄排水層可用粗碳渣、礫石或其它物質組成，厚度5cm為宜，也可用塑料排水板等其他新型排水材料，粒徑宜在4～16mm，蓄排水材料蓄水不宜超過其體積的50%，屋面面積較大時，蓄排水層宜分區設置。每區不宜大于1.0m×1.2m,且至少應有一個排水孔，排水孔處應鋪設粗骨料或加格篦，屋面排水口一般應設置兩個，有條件的可增設一個溢水口。排水口敞露，做好定期的清潔和疏通，嚴禁覆蓋，周圍嚴禁種植植物；根據屋面坡度方向、植物配置、布局，采取隱蔽式集水管、集水口、內排水和外排水，組成排水系統；砌筑花臺不能利用女兒墻為其邊，應根據排水槽寬度間隔一定距離，一般間隔距離＞20cm，材料應選用輕質材料。

蓄排水層上應設置過濾層，過濾層的總孔隙度不宜小于65%，有一定的堅固性，過濾材料接縫搭接不宜小于20cm，可用無紡布（200g/m2以下）或者其它不易腐爛又能起到過濾作用的材料。