變形縫是屋面變形集中的部位，溫差變形、建筑物合理沉降變形都會使變形縫的寬度不斷變化，所以不管屋面采用哪種防水材料，變形縫的構造和設防是一致的，即需要多道設防，并在縫的寬度變化時，不會造成防水層的破壞。變形縫有高低變形縫和等高變形縫兩種，等高變形縫又分為高出屋面等高變形縫、與屋面平齊變形縫和雙天溝變形縫等。
　　高低變形縫的一邊為立墻（高層），另一側為屋面。這時屋面防水層如為卷材時，卷材應釘壓在高層立墻上，并向縫中下凹，上部采用合成高分子卷材一邊釘壓在高層立墻上，一邊直接粘到屋面防水層上，同時在表面用金屬板單邊固定予以保護。如屋面為涂膜防水層時，也應采用與卷材防水層相同的處理方法，并做好涂膜防水層與合成高分子卷材的搭接。 
　　等高變形縫的高出屋面變形縫或雙天溝變形縫，防水層均應做到高出屋面矮墻或天溝側壁的頂面，然后在上部用合成高分子卷材覆蓋，卷材中間下凹到變形縫內20至30mm，在凹槽內墊聚乙泡沫條，兩邊與屋面上翻的防水層搭接，寬度不少于100mm，然后再在頂部鋪一層合成高分子卷材，兩邊應覆蓋住前一層合成高分子卷材的搭接縫；上部再用細石混凝土或不銹鋼蓋板蓋壓。